档案整理首先要保持历史联系的关联性
某些档案材料由于保存的时间较长，其自身和档案整理体系都会发生某些变化，也要对其进行相应的调整。对零散文件的整理，且对档案进行全过程的整理工作，包括区分全宗类档案的分类。整理工作的基本原则是大方向的整理，首先就是必须保持文件之间真实历史的联系，而文件之间历史联系主要体现为文件在其来源、形成、时间、内容和形式等方面密不可分的关联性。因此我们这个原则，首先要保持文件之间这种历史联系以及各个方面的关联性。
对档案进行全宗的整理会更加简洁有效
档案的整理必须在保持文件之间历史联系的基础上，采用更简洁、有效的方法，使整理的档案便于保管和利用。档案是要用于保管以及提供利用。在整理过程中，前面提到的一步就是全宗的组织，那么我们来认识一下对全宗如何进行组织呢？通常以通俗的定义来看，就是按照全宗群来组织和排列馆藏全宗，即把统一时间、同一系统或相同性质的全宗排列在一起以保持同类全宗之间的联系性。
档案整理的改进和创新要围绕信息管理的重要性来调整优化
对现行的企业档案整理方法进行改进和创新时，还需要注意对档案信息管理的计算机系统软件进行审查，确保其能够有效满足档案信息管理的发展需要。如在实际运用中，两者之间存在矛盾和冲突，应围绕档案信息管理需要，对档案信息管理软件程序的编写进行调整和优化，使其更好地适应档案整理方法的改进和创新要求，并使后续档案管理和利用需要得到有效满足。
档案整理的分类和实用整理步骤
根据所有的档案把不同类别的档案区分开来；鉴别每一份文件的保管期限，相同保管期限、相同类别的档案材料作为一个组卷单位，不同类别、不同保管期限 资料不能混装在同一个档案盒中。排序采用年度一保管期限一分类的方法，同一保管期限的档案资料，同一责任者的档案资料按档案形成的时间先后排序，报告、请示件要同批示、批复一起组件，批复、批示在前，请示报告在后;正件在前、附件在后;正本在前，定稿在后;转发件在前，被转发件在后重大活动资料可装订成册，作为一件。在组卷过程中，去掉 重复的档案材料，同类文件较少的能够立薄卷。