硫酸铜过量会引起鱼类组织坏死、造血组织破坏、肝脂肪增加，同时还可能残留在鱼类的鳃、肌肉和肝内，妨碍肠道的吸收，从而影响鱼类的摄食和生长，故不能经常使用。硫酸铜主要用途：用于制造其他饲盐如氯化亚铜、氯化铜、焦磷酸铜、氧化亚铜、醋酸铜、碳酸铜等。染料和颜料工业用于制造含铜单偶氮染料如活性艳蓝、活性紫等。人体内的铜元素含量低，而硫酸铜正好可以补充患者体内缺失的铜元素，从而达到的目的。但是由于硫酸铜是一种无机的化合物，所以对肠胃的刺激较大，长期服用会导致患者食欲下降。
硫酸铜虽然大多被作为杀虫药使用，但不同于其他的虫药，我们常用的虫药，大多都是温度越高，就散发的越快，活性越低。但硫酸铜却恰恰相反。硫酸铜属于重金属盐，有毒，成人致死剂量0.9g/kg。若误食，应立即大量食用牛奶、鸡蛋清等富含蛋白质食品，或者使用EDTA钙钠盐。硫酸铜的毒性除了和温度有关之外，也和水体酸碱度有关。因此，养殖户们要谨记，在给鱼泼硫酸铜时，既要留意温度，也要留意水体的酸碱度。
游泳池硫酸铜的用量为每1000立方投2-3公斤硫酸铜抑藻剂，一般是发现青苔或水体发绿时使用，也可以作为预防水藻使用。硫酸铜也是一种微量元素肥料，能提高叶绿素的稳定性，预防叶绿素不致于过早地被破坏，促进作物吸收。在工业农业上硫酸铜的应用是非常广泛的。作为杀菌剂使用：硫酸铜中Cu2-离子是重金属离子，重金属离子能使蛋白质失去活，病毒由蛋白质组成，所以能杀细菌和病毒。