万级无尘车间对温度、湿度无特殊要求时，以穿着洁净工作服不产生舒服感为宜，温度一般控制在冬季20~22℃;夏季24~26℃;波动±2℃。冬季洁净室湿度控制在30-50%，夏季洁净室湿度控制在50-70%。无尘室噪音控制：FFU的风机一般为几台甚至几十台并联使用，当设计时要考虑FFU噪音的叠加，保证《洁净室厂房设计规范GB0073-2001》中明确规定“洁净室内的噪音级(空态),非单向流洁净室不应大于60dB，单向流、混合流洁净室不应大于65dB”的要求。因此在选择风机时zui好选择、压出式、直驱后径向叶片风机，这样可以降低整体噪音。
无尘室门窗缝隙的处理一般来说，无尘室门窗大都共同具有三类构造缝隙。一类是樘的组合拼接和樘与无尘室门洞间的安装缝隙;二类是樘与开启扇之间的搭接缝隙;三类是玻璃或其他芯板的安装缝隙。通常所提的无尘室门的空气泄漏无非是由上述三种缝隙产生的问题。无尘室风机外壳的选择：由于无尘室工程的厂房按照不同的使用要求，会有不同的级别要求，如10级、100级、10000级等，这就使得无尘室工程存在不易克服的问题，而风机过滤器单元(简称FFU)的出现相对解决了这些问题。电话和火警设备不能少,在无尘室工程厂房设置电话，对讲电话，可以减少人员在洁净区走动，减少发尘量，也可在万一发生火灾时及时与外部联系，也为正常工作联系创造条件。此外，无尘室还应设置火灾报警系统，防止火情不易被外部发现而造成重大经济损失。
无尘室FFU优点：FFU系统节能显著，从而解决了空调机房庞大、空调机组运行费用增1高的集中送风的缺点。如果面积较大厂房的个别无尘室有较高洁净级别的需求，那么势必集中送风的空调机组风量较大，风机压头较高，才能克服风管管道的阻力，以及初效、中效、过滤器的阻力，才能满足这些房间洁净度的需求，这样会导致空调整体运行费用增1高，而那些较高洁净级别的房间的洁净度效果却未必能满足需求。