手性化合物的分离被认为是有挑战性的色谱分离技术之一。因为色谱分离技术往往是利用混合样品各组份在固定相（色谱填料）和流动相中的分配系数不同，当流动相推动样品中的各组份在色谱填料填充的柱中迁移时，由于各组份在两相中进行连续反复吸附和脱附或其他亲和能力作用的差异，从而形成差速移动，达到分离的目的。分子之间的物理和化学性质相差越大，越容易建立色谱分离方法。但手性分子就像左右手一样，看起来似乎一模一样，其分子组成、分子量一样，物理和化学性质也相同，只是它们在空间结构上却无法完全重合，因此分离难度很大。在精细化工、生物工程及制药工业中制备高纯度的单一对应体手性分子将具有巨大的商业价值和应用前景，因此建立对映体的手性分离方法显得日益重要。因为许多手性药l物真正起作用的是其中的一种单一对映体，而另一种对映体可能不仅无药理作用，还会有副作用。
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手性色谱填料寿命短、价格贵，让手性药l物研发工作者尽可能地寻找其它解决方案，不对称合成生产手性药l物分子就是为了避免昂贵的手性分离工艺。手性色谱填料的高额利润让世界许多色谱公司和精英前仆后继去挑战这些技术，却无法撼动日本D公司的垄断地位，说明手性色谱分离技术壁垒之高及产品产业化难度之大。
首先让我们看一下我们化学家是如何做的？对于一个微观分子世界，化学家就是上帝之手，现代科学发展到足可以让化学家设计和创造很多结构复杂的分子，只不过化学家在创造这些分子时往往没有上帝之手的灵巧和能力，化学家创造的分子会经常同时形成一对有互为镜像关系(对映体)的分子。这种对映体分子就象左右手关系一样，左手的镜像就是右手，但左右手永远无法重叠，因此这种对映体分子也就叫手性分子。
一方面化学家在不断学习上帝之手希望在创造分子时只做成一种构像的分子而不希望有另外一种构象分子的存在。虽然这一对对映体的分子所有物理化学性能都一样，但当这一对分子与具有手性结构的生命体结合时，可能只有一种构象的分子在起作用，另外一种构象的分子却没有作用甚至起反作用。就像有一些手性药l物分子，其中只有一种构象分子可以治l病，另外一种不仅不能治l病而且可能致病。20世纪50至60年代初的“海豹婴儿”事件，就是因为孕妇在怀孕期间因服用“反应停”而导致的惨痛教训，因其药l物中“反应停”的一种构象具有镇静作用,而另外一种构象对胚胎有很强的致畸作用。
手性化合物的分离被认为是很有挑战性的色谱分离技术之一。不同分子之间的物理和化学性质相差越大，越容易建立色谱分离方法。但手性分子就像左右手一样，看起来似乎一模一样，其分子组成、分子量一样，物理和化学性质也相同，只是它们在空间结构上却无法完全重合，因此分离难度比较大。
二十世纪六十年代以来，色谱技术作为一种分析技术在生命科学、环境科学、药l物分析等领域的应用日益普遍。色谱在手性药l物分离和分析发展也得到很快的发展。色谱柱是色谱系统的心脏，而色谱填料是色谱柱的关键材料，因此被誉为色谱芯。色谱填料不仅是色谱方法建立的基础，也往往是分离效果的关键因素。